图1。土壤资源类数据实体关系模型
中国土壤数据库采用中国科学院计算机网络信息中心开发的可视化数据库工具VisualDB 发布。如图1所示，若完整地描述土壤数据的本质，需要多个关系表格，而用户并不一定了解各表格间的关系。为便于查询检索，所有数据子库均提供按地点（省份）检索和专题（土壤）分类检索功能，即：查询一个地点，可获得该地点所有土壤类型的信息（分类、基本信息、典型剖面景观、发生层描述和分层理化性质）；查询一个土壤分类，可获得该分类下所有土壤类型的信息（分布地点、基本信息、典型剖面景观、发生层描述和分层理化性质）；除此之外，提供可供直接查询的分层理化性质数据表。
查询方式：首先选择首页（http://www.soil.csdb.cn）数据集导航，在您感兴趣的数据集上点击
，显示各数据集的查询视图和数据表（图2）。其次按照各数据子库的展开条，选择您感兴趣的查询视图或数据表。
想知道某省份主要土壤类型的大致分布情况，可查询土壤专题图数据库—>按省份查询,查询结果为该省份主要土壤类型及其面积百分比；想详细了解某省某县市土壤类型及养分状况，可查询中国土种数据库—>按地点查询—>选择您感兴趣的省名—>选择您感兴趣的县（市）名；一个县（市）分布有多个土壤类型(土种)，继续选择您感兴趣的土种名，然后查询该土种的性质。
图2 数据集导航
例如，如图3所示，选择中国土种数据库—>按地点查询—>选江苏—>南京, 南京市及其所属县分布有中性紫色土（亚类）、酸性粗骨土（亚类）、潴育水稻土（亚类）和潜育水稻土（亚类）。选择潴育水稻土亚类马肝土土种，可查询该土种的分布情况，一般性描述、典型剖面与统计剖面的理化性质。
如果您知道查询条件，例如土种名称，可依据高级搜索直接查询数据表（图4）。点击典型剖面理化性质，点击高级搜索
，显示设定组合查询条件。例如，在土种名称中设置包含“榆林”一词，“开始查询”，则查询出“榆林白盐砂”土种，并显示分层理化特性数据。
对于GIS文件型数据,例如中国土壤专题图数据库，通过数据分布地点和土壤类型的元数据查询,提供可浏览的压缩图像和关键属性字段。
图3._ 中国土种数据库按地点查询过程
_______________ 图4.依据高级搜索直接查询数据表
2．农田土壤肥力类数据
数据来自农田土壤肥力监测或调查、长期试验或长期定位监测等土壤科学研究活动中所产生的原始属性数据，包括：土壤类型和分类、采样地点调查信息、土壤养分、土壤物理性质、中量微量元素含量、肥料用量、作物产量和养分含量等；以及与上述数据相关的农村经济统计数据（作物和播种面积）、肥料施用统计、气象数据等。中国土壤数据库中的土壤肥力类数据包括：养分循环长期试验数据库、主要农田生态系统土壤养分现状数据库、主要农田生态系统土壤环境现状数据库、 第二次土壤普查农田肥力数据子库、第一次土壤普查农田肥力数据子库、土壤样品数据库。图5显示了农田土壤肥力类数据模型。一般地，农田土壤肥力类数据由下述关系表格组成，1）场地信息（采样地块地理位置、地形地貌、土壤类型名称、土地利用方式、采样地块耕作施肥背景信息）；2）方法信息（试验设计、采样分析方法、样品保存等）；3）施肥与作物信息（肥料施用水平和施用总量、作物产量和养分含量）；4）土壤分类信息（中国土壤发生分类与采样地块关系，中国土壤系统分类与采样地块的关系）；5）土壤养分数据（大量、中量、微量元素）；6）土壤物理性质（土壤颗粒组成和容重）；7）土壤化学性质（土壤交换性能和矿质全量）；8）土壤环境数据（重金属）。
主要农田生态系统土壤养分现状数据库、主要农田生态系统土壤环境现状数据库和土壤样品数据库来源于中国生态系统研究网络农田生态系统近年来部分监测数据， 第二次土壤普查农田肥力数据子库来自全国第二次土壤普查的耕层农化统计数据，均为结构化数据。