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    ELMER 安装和使用说明
    2009 年 5 月
    ydfeng@sccas.cn
    目录
    简介………………………………………………………………………………… (2) 一,安装……………………………………………………………………………(2) 二,使用方法………………………………………………………………………(7) 三, 小结……………………………………………………………………………(19)
    2
    简介:
    ELMER 是一个有限元程序包,用于处理多物理场问题.它是由芬兰大学, 科研实验室以及工业企业联合开发的.从 1995 年至今,一直由芬兰科学计算中 心(简称 CSC,Finish IT Center for Science)开发和维护,2005 年作为开源软件, 最新的 ELMER5.0 是采用 GNU 通用公共许可的一个开源共享软件.ELMER 的 物理模型包括流体力学,结构力学,电磁学,热传导等等.这些可被描述为偏微 分方程的模型都用有限元方法来求解.在 http:://www.csc.fi/elmer 中有详细地文 档可供下载.
    一,安装
    快速安装: 按下列顺序:matc, umfpack, mathlibs, elmergrid, meshgen2d, eio, hutiter, fem, 和 post.应用通常的编译顺序:./configure;make;make install,或应用一下脚本:: #!/bin/sh -f # Compile Elmer modules and install it ## replace these with your compilers: export CC=mpiicc export CXX=mpiicpc export FC=mpiifort export F77=mpiifort modules="matc umfpack mathlibs elmergrid meshgen2d eio hutiter fem" for m in $modules; do cd $m ./configure --prefix=/opt/elmer make make install cd .. done 所涉及到的软件包可以自动编译完成. 以上方法是 Elmer 提供的, 但在深腾 7000 上,总是出现错误.我们还是一步一步来进行编译.
    3
    分步安装: ELMER5.4.0 软件包涉及到的软件包很多,需要一步一步,按照先后顺序进行编 译. matc 5.4.0 umfpack 4.4 mathlibs 1.0.0 elmergrid 5.4.0 meshgen2d 5.0.0 eio 5.4.0 hutiter 5.4.0 fem 5.4.0 elmerparam 1.0.0 tcl tk 8.4.14 8.4.14
    front 5.4.0 elmerpost 5.4.0 hypre tetgen vtk qt-x11 ElmerGUI 编译时需要指定安装路径和编译选项,其中"-fPIC"选项必须给出,否则编译不
    能完成.应用通常的编译顺序:./configure;make;make install.
    2.0.0 1.4.2 5.4.2 4.5.2
    最后完成的编译包包含以下目录: |-- bin |-- include | `-- elmer
    |-- lib `-- share |-- elmerfront | | | |-- lib `-- tcl `-- images
    4
    |-- elmerpost | | | |-- help |-- lib `-- tcl
    `-- elmersolver |-- include `-- lib 检查安装是否正确: (1)检查包是否可以: > cd fem > make check -- cut -testing: 1dtests testing: 1sttime testing: 2ndtime -- cut -testing: streamlines testing: ThermalCompress testing: TimeAdapt [PASSED] [PASSED] [PASSED] [PASSED] [PASSED] [PASSED]
    Tests completed, passed: 52 out of total 52 tests 也可以从测试路径中进入,检查是否可用: > cd fem/tests > ./runtests PoissonBEM testing: PoissonBEM [PASSED] Tests completed, passed: 1 out of total 1 tests (2)检查 MPI 是否能启动: > cd tests/heateq-par > mpirun -np 2 ../../src/ElmerSolver_mpi 在深腾 7000 上要用 bsub 来提交.测试结 果: ELMER SOLVER (v 5.4.0) STARTED AT: 2009/08/07 16:25:36

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