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    ◇◇新语丝(www.xys.org)(xys.dxiong.com)(xys.3322.org)(xys.freedns.us)◇◇
    质疑易国华给方舟子的答复
    作者:Lysor
    唉,如果我是易博士,我早就闭嘴了。 
    1:“基因工程菌并非戴老师所说的“普通”大肠杆菌,因其含有质粒,而且PIII噬菌体载
    体系统质粒拷贝数很低。” 
    实验室保存的大肠杆菌有多少没有质粒?都拿去菌株保存中心才行?pCANTAB5E是低拷贝质
    粒嘛?复制元件是ColE1的,你自己说是不是吧,实在不行看《分子克隆》第二版第一面。
    而且我还怀疑是衍生的ColE1,也就是pUC的,因为很多公司所说的ColE1 ori就是pUC ori
    。说到低拷贝质粒,我到可以告诉你几个:BL21(DE3) pLysS菌株中的pLysS,用的p15A复
    制元件;JM109菌株中的F'因子,以及衍生出的BAC载体,单拷贝。这些菌株很难保存吗?
    2:“对于小片段的回收,我用的是2%的低熔点琼脂糖” 
    我前两年也用过2%的低熔点琼脂糖,不过是回收150bp的片断,因为当时用的BioSTAR的
    GlassMilk回收下限是200bp。Marker是华美产pBR322/MspI,琼脂糖是Sigma产。可惜的是我
    找出那一张电泳图来实在看不到50bp左右的Marker带在哪里。当然,易博士可以用的东东
    好一些,请问是什么牌子的?再说啦,这种PCR产物酶切了,要是我肯定不做回收,直接连
    就是了,又没有什么问题。看了他的文章,我就怀疑他做这个试验没有?本来不需要做这
    个回收,他们自己实验室的人也承认了。但是,没有做的东西就不要写,不然就是做假!
    3:“但直到现在,她们并没有重复实验并积极地在相关专业杂志上发表文章,或向JGV编
    辑部反映情况她们已经证伪了。” 
    不才以为,重复这个实验有一个最大的障碍,那就是易博士首先是当今世界上唯一一个能
    够做出对虾细胞空斑的人,然后才是世界上唯一一个能够用这个十肽抑制空斑的人。别人
    连空斑都做不出,合成个十肽固然容易,但是怎么用这个十肽呢?就比如易博士的屠龙刀
    ,别人学了也没用,因为找不到龙。所以,我觉得这个东东还是易博士重复比较好了那么
    一点点。 
    4:还有那个电转化的问题易博士没有说。“The ligation mixture was transformed in
    to E. coli TG1 cells by electroporation using a Gene Pulser electroporation 
    apparatus (Bio-Rad) at 2.5 kV, 200 ohms, 25 mF in 0.4 cm pre-chilled cuvettes.”
    这个ligation mixture如果按易博士这个参数来弄,多半是一道闪电,当然啦,如果体积
    >500ul,就只有一点水蒸汽了。但是脉冲时间肯定<4ms,也就是没有用。以上我用18M oh
    mes的纯水配合Fermentas的T4 ligase buffer试过。 
    另外一个问题没有试过,但是要请教,文献上说转化E coli需要的电场强度为12-18kv/cm,
    只要不出现火花,强度越大,转化效率越高,所以做文库的人一般都会取上限,胆小的
    取下限。可是您的电场强度只有下限的一半,帮主,也太低了吧。 
    只要做过电转化的人都可以知道,这个参数是胡说。 
    Fermentas T4 DNA Ligase(#EL0335)的说明书:“It is necessary to extract DNA 
    with chloroform and precipitate with ethanol prior to electrotransformation.”
    黑体字,不是瞎子都看得见。 
    "Efficient Cloning and Electro-transformation of Large Eukaryotic DNA Fragments"   
    http://www.bio-rad.com/LifeScience/pdf/Bulletin_1358.pdf
    "E. coli Pulser&#8482; Transformation Apparatus Operating Instructions and App
    
    

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